В этом фильме переплетаются истории нескольких душ, и, чтобы в деталях понять замысел Дэвида Митчелла (автора одноимённой книги) и братьев/сестёр Вачовски, нужно внимательно проследить путь каждой из них, что при первом просмотре фильма несколько затруднено, поскольку одни и те же актёры, изображающие путь каждой души́, играют персонажей разного пола (в прекрасном гриме), так что они редко узнаваемы.
Центральной нитью через весь фильм проходит тезис: «Всё связано». По сути, один и тот же коллектив душ на протяжении многих поколений разыгрывает спектакль жизни, чтобы понять себя, открыть Истину, обрести подлинные ценности, что в совокупности и складывается в одно общее кино – кино (или рассказ), которое в конечном счёте смотрят (или слушают) дети – ду́ши, которым свой путь ещё только предстоит пройти. Фактически, с просмотра и глубокого осмысления этого «кино» и должен начинаться путь каждого нового поколения, чтобы изначально была видна (по возможности) вся картина мироздания, чтобы прожить жизнь осознанно в её глобальном смысле, а не как слепой персонаж с эгоцентричными целями, борющийся за мелочные личные выгоды под руководством страха (шёпота старины Джорджи). Всю суть жизни (как её понимают авторы), пожалуй, выражает манифест Садми:
«Мы не хозяева своих жизней. От рождения до смерти мы связаны с другими – прошлым и настоящим. И каждый наш проступок, как и каждое доброе дело, рождает наше будущее. Это последствия каждого индивидуума в масштабах вечности. Смерть – это всего лишь врата: когда они закрываются, открываются другие». – Остаётся добавить, что путь этот проходит Разум, и каким бы долгим ни был этот путь, в конечном итоге зло всегда истребляется, безумие уходит в небытие, а побеждает Истина и здравый смысл. И эта Истина – Любовь. Путь к ней через боль утрат и счастье открытий выливается в грандиозную симфонию – «Облачный Атлас» – высшее достижение, ради которого (по факту) мы и проживаем своих персонажей.
Ещё один важный тезис фильма: «Я не потерплю преступного ущемления своих прав!» – даже если за это придётся поплатиться жизнью. Попрание прав человека, таких как: свобода, Истина, Любовь, жизнь, выбор, счастье, достоинство, – это по сути уничтожение самого́ человека, низведение его до нечеловеческого существования. Поэтому для человека ничто не может быть оправданием для смирения и принятия такого существования вопреки хоть какому-то (пусть даже частичному) осознанию своей подлинной сущности.